Хорхе Лоренцо спечели втората си победа в MotoGP на пистата Мотеги, като испанецът поведе Ямаха към двойна победа. Валентино Роси завърши на втора позиция. Дани Педроса показа, че негови контузии преди началото на сезона са зад гърба му, като завърши на трета позиция. Зад него остана победителят от Катар - Кейси Стонър. Роси поведе в началото на надпреварата, докато Стонър с Дукати се забави и остана седми. В началото изглеждаше, че италианецът ще спечели комфортна и лесна победа, но след няколко обиколки Лоренцо изпревари добре стартиралите Хонди и започна да доближава лидера. В продължение на седем обиколки младият испанец преследваше съотборника си, докато не го изпревари в деветия тур. След това постепенно двете Ямахи се отдалечиха пред състезателите на Хонда. Роси постепенно започна да губи темпо, докато Педроса започна да го доближава. Двамата се изпревариха един друг на няколко пъти, но накрая все пак по-опитният пилот запази втората си позиция.
И след като беше станал пети, Стонър нямаше темпото да достигне до първата позиция, но все пак успя да изпревари Андреа Довициозо, за да завърши накрая на четвърто място. Марко Меландри пък може да бъде горд със своята шеста позиция с Кавазаки, като се пребори с Лорис Капироси след дълга битка. След инцидент в началото на надпреварата, който го остави назад сред състезателите, Мика Калио успя да се заслужи осмата позиция, с което доказа, че действително е качествен пилот. След толкова малко тестови километри за повечето отбори не бе голяма изненада, че няколко от състезателите не успяха да направят правилния избор с гумите. Това важеше с пълна сила за Крис Вермюлен със Сузуки и Колин Едуардс с Ямаха. Юки Такахаши още в началото удари Ники Хейдън отзад, с което надпреварата приключи за тях още в първия тур. Сете Гибернау бе другият отпаднал.
